Ersun Yanal’ın yönetiminde 2003-2004 sezonunda Gençlerbirliği UEFA Kupası‘nda sırasıyla Blackburn Rovers, Sporting Lizbon ve Parma’yı eleyerek çeyrek finale çıkmış; çeyrek finalde o sezonun UEFA Kupası şampiyonu Valencia’ya ikinci maçta uzatma bölümünde yediği golle elenmiştir. O sene kupayı kaldıran Valencia CF’yı turnuva boyunca yenmeyi başarabilen tek takım Ankara’da 1-0’lık sonuçla Gençlerbirliği oldu

Ersun Yanal yönetiminde Gençlerbirliği 2002-2003 ve 2003-2004 sezonlarında Türkiye Kupası’nda finale çıkmış olmasına rağmen iki finali de Trabzonspor’a kaybetmiştir.